￭ 학력 및 경력

1996 의학, 경희대학교 의과대학

1997-2001 산부인과 전공의, 삼성서울병원

2004-2009 생물정보학 협동과정, 서울대학교

2010-2019 연구관, 과장, 국립보건연구원

2020-현재 교수, 가천대학교 의과대학 의료정보학 교실

￭ 소개

중개 생물정보학 (translational bioinformatics) 연구실에서는 생물정보학의 방법론과 데이터베이스를 이용하여 질병에 관련된 중개연구를 진행한다. 특히, 전유전체연관분석 (genome-wide association study)의 결과를 공개 기능유전체(functional genomics)자료와 같이 분석하여 서열변이에 의하여 질병이 발생하는 기전을 발굴하고 이를 바이오마커 발굴과 치료제 탐색에 응용한다. 이러한 목적을 위하여 서로 이질적인 의생명 자료들 (오믹스, 생물학 데이터베이스 및 서지자료)의 통합분석을 위하여 데이터 마이닝 기법을 비롯한 기존의 정보학 방법을 응용하거나, 새로운 방법론을 개발하는 작업을 수행한다. 그리고 의생물연구의 효율성 증대를 위한 LLM을 포함한 인공지능을 이용한 AI transformation (Ax)에 대한 연구를 수행 중에 있다. 이와 관련하여, LLM과 기존의 공개 유전체 자료를 이용한 질병의 바이오 마커 발굴과 유전자 조절 네트워크 구축에 관한 연구를 수행하고 있다. 그리고 Ax를 적용한 유체역학 기반의 심혈관질환 예측마커 발굴에 대한 연구도 진행하고 있다. 

￭ 키워드

생물정보학, 중개연구, 공개 데이터베이스, 통합분석, 데이터 마이닝, 멀티오믹스 데이터

￭ 최근 연구업적(2020-현재) 

1. Cho SB. Transcriptomic Profile of Isocitrate Dehydrogenase Mutant Type of Lower-Grade Glioma Reveals Molecular Changes for Prognosis. Biomedicines. 2025 Sep 14;13(9):2263. doi: 10.3390/biomedicines13092263. PMID: 41007824; PMCID: PMC12467759.

2. Cho SB. Measurement of Disease Comorbidity Using Semantic Profiling of Disease Genes. Int J Mol Sci. 2025 Apr 21;26(8):3906. doi: 10.3390/ijms26083906. PMID: 40332751; PMCID: PMC12028026.

3. Cho SB. Comorbidity Genes of Alzheimer's Disease and Type 2 Diabetes Associated with Memory and Cognitive Function. Int J Mol Sci. 2024 Feb 12;25(4):2211. doi: 10.3390/ijms25042211. PMID: 38396891; PMCID: PMC10889845.

4. Paik H, Lee J, Jeong CS, Park JS, Lee JH, Rappoport N, Kim Y, Sohn HY, Jo C, Kim J, Cho SB. Identification of a pleiotropic effect of ADIPOQ on cardiac dysfunction and Alzheimer's disease based on genetic evidence and health care records. Transl Psychiatry. 2022 Sep 16;12(1):389. doi: 10.1038/s41398-022-02144-0. PMID: 36114174; PMCID: PMC9481623.

5. Cho SB, Jang JH, Chung MG, Kim SC. Exome Chip Analysis of 14,026 Koreans Reveals Known and Newly Discovered Genetic Loci Associated with Type 2 Diabetes Mellitus. Diabetes Metab J. 2021 Mar;45(2):231-240.doi: 10.4093/dmj.2019.0163. Epub 2020 Jul 28. PMID: 32794382; PMCID: PMC8024163.