융합의과학과
의생명과학 전공 참여교수 및 프로필입니다.
■ 학력 및 경력
2005 이학사, 서울대학교 생명과학부
2012 박사후 연구원, 서울대학교
생명과학부
2013
Post-doc, Harvard Medical School, MGH, Broad Institute of MIT
and Harvard
2020 연구조교수, 서울대학교 생명과학부
2021
조교수, 가천대학교
의과대학 의예과
■ 소개
저희 실험실은 세포 분화 경로를 재구성하여 세포의 분화 조절 메커니즘을 규명하기 위해, 염기서열 분석을 기반으로 한 멀티오믹스 방법을 개발, 적용하고 있습니다. 세포내의 모든 정보를 단일 세포에서 얻어내기 위하여 새로운 cell barcoding, fate recording seq, induced mutation 등을 이용한 기술 개발과, 다양한 정보의 염기서열 데이터를 통합하여 분석하는 컴퓨터 알고리즘을 개발, 적용하고 있습니다. 이 결과를 바탕으로 재구성된 세포 분화 경로 모델과 그 메커니즘을 바탕으로 특정 세포의 분화 방향을 조절하여 유전적 발달 질환이나 질병 세포를 치료하는 것을 목표로 하고 있습니다.
■ 키워드
유전자 발현,
후성유전학, 줄기세포, 배아발달, 세포운명결정, 단일세포연구, 시퀀싱분석, 멀티오믹스 기술개발
■ 최근 연구업적(2018-현재) (최근 5년간의
주요 연구 실적)
1.
Yu, Y.S., Shin, H-J.R., Kim, D., Baek, S.A., Choi, S.A., Ahn, H., Shamim, A.,
Kim, J., Kim, I.S., Kim, K.K., Won, K., Baek, S.H., (2020) Pontin
Arginine Methylation by CARM1 Is Crucial for Epigenetic Regulation of
Autophagy. Nature Comm., 11, 6297.
2.
Kim, I.S., Wu, J., Rahme, G.J., Battaglia, S., Dixit, A., Gaskell, E.,
Chen, H., Pinello, L., and Bernstein, B.E. (2020). Parallel Single-Cell RNA-Seq
and Genetic Recording Reveals Lineage Decisions in Developing Embryoid Bodies. Cell
Reports, 33, 108222.
3.
Lee, I.K., Song, H., Kim, H., Kim, I.S., Tran, N. L., Kim, S., Oh, S.
J.*, Lee, J. M.*, (2020) RORα Regulates Cholesterol Metabolism of CD8+ T Cell
for Anti-Cancer Immunity. Cancers, 12 (7):1733
4.
Brumbaugh, J.*, Kim, I.S.*, Ji, F., Huebner, A., Di Stefano, B.,
Schwarz, B.A., Charlton, J., Coffey, A., Choi, J., Walsh, R.M., Schindler,
J.W., Anselmo, A., Meissner, A., Sadreyev, R.I., Bernstein, B.E., Hock, H., and
Hochedlinger, K. (2019) Inducible histone K-to-M mutations are dynamic tools to
probe the physiological role of site-specific histone methylation in vitro and
in vivo. Nature Cell Biology, 21, 1449–1461. (*co-first author)
5.
Oh, S.K., Kim, D., Kim, K., Boo, K., Yu, Y.S., Kim, I.S., Jeon, Y., Im, S.K.,
Lee, S.H., Lee, J.M., Ko, Y.H., Lee, H., Park, D., Fang, S., and Baek, S.H.
(2019) RORα Is Crucial for Attenuated Inflammatory Response to Maintain
Intestinal Homeostasis. PNAS, 116 (42): 21140-21149.
6.
Lee, M.K.*, Kim, I.S.*, Park, K.C., Baek, S.H., and Kim, K.I. (2018)
Mitosis-specific Phosphorylation of Mis18 by Aurora B Kinase Enhances
Kinetochore Recruitment of Polo-like
Kinase 1. Oncotarget, 9, 1563-1576. (*co-first author)